Die Geschichte der Mikronationen ist eng an die Entwicklung des Internets zu einem Massenmedium gekoppelt. In der zweiten Hälfte der 1990er Jahre entstanden die ersten Nationen im Netz, welche es sich zur Aufgabe machten, komplette Staats- und Regierungsgebilde zu simulieren. Mit der steigenden Verbreitung des Internets und der Vereinfachung bei der technischen Gestaltung erhöhte sich die Zahl der MN nach dem Jahrtausendwechsel stetig.
Die ersten länderübergreifenden Organisationen wurden gegründet, intermikronationale Projekte wie Informationsportale starteten und für die deutschsprachige MN-Gemeinschaft entstand eine eigene freie Enzyklopädie. Dem Drang nach immer mehr länderübergreifenden Interaktionen trug auch die Schaffung der ersten "globalen" Karte Rechnung, damals noch unter dem Dach einer der ersten multinationalen Organisationen, der UVNO.
Mit steigender Zahl der Mikronationen stieg auch die Zahl der Ausgestaltungsvarianten. Während ein Teil der Mitspieler größeren Wert auf realitätsbezogene Gestaltung ihres virtuellen Staatswesens legten, gab ein anderer Teil einer vorrangig kulturellen Ausgestaltung den Vorrang. Wieder andere Nationen und deren Spieler sahen eher den Spaß- und Unterhaltungsfaktor als wichtig an oder begaben sich mit ihrer Simulation weiter in Vergangenheit oder Zukunft.
Mit den unterschiedlichen Ausgestaltungsansätzen kam es auch zu unterschiedlichen Vorstellungen bezüglich der Weltkarte innerhalb der deutschen Mikronationen, welche im Laufe der Zeit zu mehreren Kartenprojekten und damit zu einer mehr oder weniger starken Trennung der MN-Gemeinschaft führte und noch immer führt.
Technisch entwickelten sich die Mikronationen fast parallel zum Internet. Mit immer breiteren Zugangsmöglichkeiten zu preiswertem oder gar kostenlosem Webspace, guter und leistungsfähiger Software und schnellen, zuverlässigen sowie erschwinglichen Onlinezugängen boten sich steigende Möglichkeiten, was die Anzahl der MN, aber auch den technisch organisatorischen Aufwand bei der Ausgestaltung betraf.
So unterschiedlich und vielfältig die Gemeinschaft der Mitspieler und deren persönliche Fähig- und Möglichkeiten schon immer sind, so verschieden zeigten und entwickelten sich die einzelnen Mikronationen - vom reinen Blog-Staat über eher einfach gestaltete Kostenlos-Foren bis hin zu aufwendigen Kombinationen aus Hompages, Portalen und individuell programmierten Foren.